Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb3O54890 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms