Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DffaO54786 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DffaO54786 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DffaO54786 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DffaO54786 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DffaO54786 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DffaO54786 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DffaO54786 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DffaO54786 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DffaO54786 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DffaO54786 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DffaO54786 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DffaO54786 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DffaO54786 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DffaO54786 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DffaO54786 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DffaO54786 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DffaO54786 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DffaO54786 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DffaO54786 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DffaO54786 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DffaO54786 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DffaO54786 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DffaO54786 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DffaO54786 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DffaO54786 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DffaO54786 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DffaO54786 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DffaO54786 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DffaO54786 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DffaO54786 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DffaO54786 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DffaO54786 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DffaO54786 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DffaO54786 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DffaO54786 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DffaO54786 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DffaO54786 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DffaO54786 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DffaO54786 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DffaO54786 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DffaO54786 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DffaO54786 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DffaO54786 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DffaO54786 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DffaO54786 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DffaO54786 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DffaO54786 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DffaO54786 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DffaO54786 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DffaO54786 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DffaO54786 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DffaO54786 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DffaO54786 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DffaO54786 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DffaO54786 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DffaO54786 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DffaO54786 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DffaO54786 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DffaO54786 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DffaO54786 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DffaO54786 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DffaO54786 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DffaO54786 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DffaO54786 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DffaO54786 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DffaO54786 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DffaO54786 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DffaO54786 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DffaO54786 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DffaO54786 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DffaO54786 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DffaO54786 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DffaO54786 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DffaO54786 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DffaO54786 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DffaO54786 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DffaO54786 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DffaO54786 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DffaO54786 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DffaO54786 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DffaO54786 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DffaO54786 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DffaO54786 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DffaO54786 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DffaO54786 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DffaO54786 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DffaO54786 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DffaO54786 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DffaO54786 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DffaO54786 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DffaO54786 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DffaO54786 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DffaO54786 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DffaO54786 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DffaO54786 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DffaO54786 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DffaO54786 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DffaO54786 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DffaO54786 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms