Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FxnO35943 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FxnO35943 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FxnO35943 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FxnO35943 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FxnO35943 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FxnO35943 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FxnO35943 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FxnO35943 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FxnO35943 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FxnO35943 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FxnO35943 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FxnO35943 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FxnO35943 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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FxnO35943 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FxnO35943 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FxnO35943 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FxnO35943 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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FxnO35943 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FxnO35943 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FxnO35943 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FxnO35943 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FxnO35943 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FxnO35943 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FxnO35943 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FxnO35943 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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FxnO35943 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FxnO35943 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FxnO35943 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FxnO35943 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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FxnO35943 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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FxnO35943 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FxnO35943 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FxnO35943 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FxnO35943 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FxnO35943 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FxnO35943 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FxnO35943 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FxnO35943 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FxnO35943 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FxnO35943 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FxnO35943 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FxnO35943 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FxnO35943 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FxnO35943 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FxnO35943 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FxnO35943 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FxnO35943 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FxnO35943 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FxnO35943 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FxnO35943 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FxnO35943 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FxnO35943 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FxnO35943 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FxnO35943 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FxnO35943 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FxnO35943 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FxnO35943 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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