Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gp1baO35930 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms