Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Notch2O35516 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch2O35516 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch2O35516 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch2O35516 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch2O35516 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch2O35516 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch2O35516 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch2O35516 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Notch2O35516 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Notch2O35516 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch2O35516 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch2O35516 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Notch2O35516 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms