Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1dO35473 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1dO35473 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C1dO35473 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1dO35473 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1dO35473 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1dO35473 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C1dO35473 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1dO35473 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1dO35473 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1dO35473 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1dO35473 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1dO35473 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1dO35473 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1dO35473 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1dO35473 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1dO35473 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1dO35473 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1dO35473 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1dO35473 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1dO35473 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1dO35473 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1dO35473 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1dO35473 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1dO35473 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1dO35473 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1dO35473 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1dO35473 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1dO35473 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1dO35473 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1dO35473 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C1dO35473 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1dO35473 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1dO35473 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1dO35473 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1dO35473 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1dO35473 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1dO35473 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1dO35473 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1dO35473 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1dO35473 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C1dO35473 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1dO35473 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1dO35473 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1dO35473 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1dO35473 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1dO35473 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1dO35473 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1dO35473 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1dO35473 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1dO35473 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1dO35473 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1dO35473 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1dO35473 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1dO35473 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1dO35473 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1dO35473 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1dO35473 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1dO35473 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1dO35473 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1dO35473 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1dO35473 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1dO35473 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1dO35473 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1dO35473 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1dO35473 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1dO35473 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1dO35473 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1dO35473 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1dO35473 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1dO35473 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1dO35473 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1dO35473 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C1dO35473 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C1dO35473 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1dO35473 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1dO35473 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1dO35473 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1dO35473 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1dO35473 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1dO35473 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1dO35473 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1dO35473 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1dO35473 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1dO35473 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1dO35473 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1dO35473 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1dO35473 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1dO35473 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1dO35473 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1dO35473 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1dO35473 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1dO35473 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1dO35473 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1dO35473 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1dO35473 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1dO35473 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1dO35473 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1dO35473 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C1dO35473 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms