Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd2O35392 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd2O35392 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd2O35392 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd2O35392 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd2O35392 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd2O35392 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd2O35392 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd2O35392 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd2O35392 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd2O35392 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd2O35392 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd2O35392 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms