Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn1O35350 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn1O35350 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn1O35350 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn1O35350 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn1O35350 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn1O35350 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn1O35350 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn1O35350 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms