Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms