Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms