Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

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Length 966 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms