Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms