Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad6O35182 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad6O35182 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad6O35182 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad6O35182 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad6O35182 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad6O35182 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad6O35182 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad6O35182 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad6O35182 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad6O35182 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms