Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra3O35118 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra3O35118 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra3O35118 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra3O35118 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra3O35118 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra3O35118 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra3O35118 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra3O35118 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra3O35118 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra3O35118 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra3O35118 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra3O35118 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra3O35118 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra3O35118 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Gfra3O35118 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfra3O35118 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfra3O35118 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfra3O35118 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gfra3O35118 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra3O35118 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra3O35118 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra3O35118 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gfra3O35118 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gfra3O35118 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gfra3O35118 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra3O35118 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra3O35118 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gfra3O35118 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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