Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha8O09127 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha8O09127 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha8O09127 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha8O09127 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha8O09127 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha8O09127 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha8O09127 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha8O09127 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha8O09127 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha8O09127 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms