Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms