Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckarO08786 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckarO08786 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckarO08786 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckarO08786 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckarO08786 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckarO08786 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckarO08786 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckarO08786 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckarO08786 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CckarO08786 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckarO08786 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckarO08786 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckarO08786 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckarO08786 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CckarO08786 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckarO08786 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckarO08786 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckarO08786 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckarO08786 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckarO08786 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckarO08786 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckarO08786 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckarO08786 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckarO08786 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckarO08786 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckarO08786 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckarO08786 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckarO08786 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckarO08786 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckarO08786 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckarO08786 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckarO08786 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckarO08786 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckarO08786 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckarO08786 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CckarO08786 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CckarO08786 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CckarO08786 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CckarO08786 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckarO08786 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckarO08786 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckarO08786 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckarO08786 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CckarO08786 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckarO08786 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckarO08786 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckarO08786 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckarO08786 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckarO08786 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckarO08786 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckarO08786 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckarO08786 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckarO08786 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckarO08786 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CckarO08786 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckarO08786 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckarO08786 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckarO08786 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckarO08786 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckarO08786 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckarO08786 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckarO08786 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckarO08786 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CckarO08786 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckarO08786 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckarO08786 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CckarO08786 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckarO08786 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckarO08786 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckarO08786 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckarO08786 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckarO08786 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckarO08786 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckarO08786 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckarO08786 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckarO08786 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckarO08786 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckarO08786 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckarO08786 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckarO08786 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckarO08786 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckarO08786 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckarO08786 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CckarO08786 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CckarO08786 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckarO08786 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckarO08786 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckarO08786 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckarO08786 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckarO08786 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckarO08786 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms