Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsmbO08540 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsmbO08540 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsmbO08540 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsmbO08540 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MsmbO08540 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MsmbO08540 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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