Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp35M0QWN7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp35M0QWN7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp35M0QWN7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp35M0QWN7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp35M0QWN7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp35M0QWN7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp35M0QWN7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp35M0QWN7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp35M0QWN7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp35M0QWN7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp35M0QWN7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp35M0QWN7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp35M0QWN7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp35M0QWN7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp35M0QWN7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp35M0QWN7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp35M0QWN7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp35M0QWN7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms