Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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