Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms