Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms