Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms