Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Zfp616J3QN14 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms