Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms