Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Gm3336J3QMQ6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3336J3QMQ6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3336J3QMQ6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3336J3QMQ6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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