Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm20834J3QM72 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm20834J3QM72 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20834J3QM72 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm20834J3QM72 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm20834J3QM72 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20834J3QM72 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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