Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34c3J3QJW5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34c3J3QJW5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34c3J3QJW5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34c3J3QJW5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34c3J3QJW5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34c3J3QJW5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34c3J3QJW5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34c3J3QJW5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34c3J3QJW5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34c3J3QJW5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34c3J3QJW5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34c3J3QJW5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34c3J3QJW5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34c3J3QJW5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c3J3QJW5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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