Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20830J3KML6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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