Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms