Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Usp17lcG5E8I7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Usp17lcG5E8I7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Usp17lcG5E8I7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Usp17lcG5E8I7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp17lcG5E8I7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Usp17lcG5E8I7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Usp17lcG5E8I7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Usp17lcG5E8I7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Usp17lcG5E8I7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp17lcG5E8I7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp17lcG5E8I7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp17lcG5E8I7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp17lcG5E8I7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp17lcG5E8I7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp17lcG5E8I7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp17lcG5E8I7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp17lcG5E8I7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp17lcG5E8I7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Usp17lcG5E8I7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC20■□□□□ 0.79
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Usp17lcG5E8I7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp17lcG5E8I7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp17lcG5E8I7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp17lcG5E8I7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp17lcG5E8I7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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