Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms