Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trip12G5E870 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip12G5E870 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip12G5E870 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip12G5E870 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip12G5E870 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip12G5E870 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip12G5E870 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip12G5E870 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip12G5E870 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip12G5E870 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip12G5E870 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip12G5E870 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip12G5E870 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip12G5E870 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip12G5E870 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms