Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgef1G3X9K3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms