Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms