Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms