Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ercc6F8VPZ5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms