Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms