Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
D430041D05RikF6ZGR6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
D430041D05RikF6ZGR6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms