Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms