Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms