Protein–RNA interactions for Protein: F6XZJ7

Samd15, Sterile alpha motif domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd15F6XZJ7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd15F6XZJ7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd15F6XZJ7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms