Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms