Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms