Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms