Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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TrdnE9Q9K5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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TrdnE9Q9K5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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TrdnE9Q9K5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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TrdnE9Q9K5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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TrdnE9Q9K5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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TrdnE9Q9K5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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TrdnE9Q9K5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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