Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms