Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L6

Foxn2, Forkhead box N2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn2E9Q7L6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Foxn2E9Q7L6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxn2E9Q7L6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms