Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms