Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FancfE9Q5Z5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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FancfE9Q5Z5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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FancfE9Q5Z5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms